Mohamed Mourdas

Mourdas

Mohamed

Fonction

Ingénieur d'étude

Institut d’appartenance

IRD

Je développe des méthodes et des outils bio-informatiques pour la gestion, l’indexation et l’accès efficace à de grandes données génomiques. Je travaille également sur l’analyse et la visualisation interactive des pangénomes et des graphes de variation, avec des applications à l’étude de la diversité génomique et des éléments transposables.

Mots clés

Bioinformatique
Pangénomique
Rétrotransposons

Publications

Mohamed M., Sabot F., Varoqui M., Mugat B., Audouin K., Pelisson A., Fiston-Lavier A.-S., Chambeyron S. 2023. TrEMOLO: accurate transposable element allele frequency estimation using long-read sequencing data combining assembly and mapping-based approaches. Genome Biology. 24. 63.

Mohamed M., Dang T. M. N., Ogyama Y., Burlet N., Mugat B., Boulesteix M., Merel V., Veber P., Salces-Ortiz J., Severac D., Pelisson A., Vieira C., Sabot F., Fablet M., Chambeyron S. 2020. A transposon story: from TE content to TE dynamic invasion of Drosophila genomes using the single-molecule sequencing technology from Oxford Nanopore. Cells. 9(8). 1776.