Poncet Valérie – Diade

Valérie

Poncet

Fonction

Directrice de recherche

Responsabilité(s) collective(s)

Équipe(s)

DYNADIV

Institut d’appartenance

IRD

J’étudie le rôle des processus évolutifs dans la diversité et les adaptations de caféiers indigènes en Afrique. Depuis de nombreuses années, je mène des recherches interdisciplinaires avec des partenaires du Sud global, en particulier à l’interface entre la génétique des populations, la génomique, l’écologie et la biogéographie. J’explore également l’impact des activités humaines sur les caféiers cultivés, dans le but d’optimiser la conservation et l’usage des ressources génomiques du café. En Ouganda, j’étudie la transition vers un système de caféiculture agroforestière durable.

Mots clés :

Diversité
Évolution
Domestication
Génomique
Coffea

Publications

Vi T., Le T. N., Cubry P., Phan V. H., Dinh T. T. O., Tran T. B. N., Nguyen V. T., Millet C. P., Kambale J.-L., Gba Kossia Manzan K., Musoli P., Sumirat U., Mahinga J. C., Stoffelen P., Zhang D., Marraccini P., Vigouroux Y., Khong G. N., Poncet V.. 2025. Out of Africa: The genomic footprints of Vietnamese Robusta coffee. PLOS ONE. 20(5). e0324988.

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Millet C. P., Allinne C., Vi T., Marraccini P., Verleysen L., Couderc M., Ruttink T., Zhang D., Sanchez W., Tranchant-Dubreuil C., Jeune W., Poncet V.. 2024. Haitian coffee agroforestry systems harbor complex arabica variety mixtures and under-recognized genetic diversity. PLOS ONE. 19(4). e0299493.

Millet C. P., Delahaie B., Georget F., Allinne C., Solano-Sánchez W. Zhang D., Jeune W., Toniutti L., Poncet V.. 2024. Guadeloupe and Haiti’s coffee genetic resources reflect the crop’s regional and global history. Plants, People, Planet. 7(1). 245-262.

Salojaervi J., Rambani A., Yu Z., Guyot R., Strickler S., Lepelley M., Wang C., Rajaraman S., Rastas P., Zheng C. F., Munoz D. S., Meidanis J., Paschoal A. R., Bawin Y., Krabbenhoft T. J., Wang Z. Q., Fleck S. J., Aussel R., Bellanger L., Charpagne A., Fournier C., Kassam M., Lefebvre G., Metairon S., Moine D., Rigoreau M., Stolte J., Hamon P., Couturon E., Tranchant-Dubreuil C., Mukherjee M., Lan T. Y., Engelhardt J., Stadler P., De Lemos S. M. C., Suzuki S. I., Sumirat U., Wai C. M., Dauchot N., Orozco-Arias S., Garavito A., Kiwuka C., Musoli P., Nalukenge A., Guichoux E., Reinout H., Smit M., Carretero-Paulet L., Guerreiro O., Braghini M. T., Padilha L., Sera G. H., Ruttink T., Henry R., Marraccini P., Van de Peer Y., Andrade A., Domingues D., Giuliano G., Mueller L., Pereira L. F., Plaisance S., Poncet V., Rombauts S., Sankoff D., Albert V. A., Crouzillat D., De Kochko A., Descombes P.. 2024. The genome and population genomics of allopolyploid Coffea arabica reveal the diversification history of modern coffee cultivars. Nature Genetics. 56. 721-731.

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De Aquino Oliveira S., Kiwuka C., Tournebize R., Gain C., Marraccini P., Mariac C., Bethune K., Couderc M., Cubry P., Andrade A., Lepelley M., Darracq O., Crouzillat D., Anten N., Musoli P., Vigouroux Y., De Kochko A., Manel S., François O., Poncet V.. 2022. Adaptive potential of Coffea canephora from Uganda in response to climate change. Molecular Ecology. 31(6). 1800-1819.

Kiwuka C., Goudsmit E., Tournebize R., De Aquino Oliveira S., Douma J. C., Bellanger L., Crouzillat D., Stoffelen P., Sumirat U., Legnate H., Marraccini P., De Kochko A., Carvalho Andrade A., Wasswa Mulumba J., Musoli P., Anten N. P. R., Poncet V.. 2021. Genetic diversity of native and cultivated Ugandan Robusta coffee (Coffea canephora Pierre ex A. Froehner): Climate influences, breeding potential and diversity conservation. PLOS ONE. 16(2). e0245965.

Merot‐L'anthoene V., Tournebize R., Darracq O., Rattina V., Lepelley M., Bellanger L., Tranchant-Dubreuil C., Coulee M., Pegard M., Metairon S., Fournier C., Stoffelen P., Janssens S., Kiwuka C., Musoli P., Sumirat U., Legnate H., Kambale J., Ferreira Da Costa Neto J., Revel C., De Kochko A., Descombes P., Crouzillat D., Poncet V.. 2019. Development and evaluation of a genome-wide Coffee 8.5K SNP array and its application for high-density genetic mapping and for investigating the origin of Coffea arabica L.. Plant Biotechnology Journal. 17(7). 1418-1430.

Poncet V., Birnbaum P., Burtet-Sarramegna V., De Kochko A., Fogliani B., Gateble G., Isnard S., Jaffre T., Job D., Munoz F., Munzinger J., Scutt C.P., Tournebize R., Trueba S., Pillon Y.. 2019. Amborella – Bearing witness to the past?. Annual Plant Reviews Online. 2(3). 1-41.

Tournebize R., Poncet V., Jakobsson M., Vigouroux Y., Manel S.. 2019. McSwan: A joint site frequency spectrum method to detect and date selective sweeps across multiple population genomes. Molecular Ecology Resources. 19(1). 283-295.