Équipe

GENOPS

Étude des Génomes des Plantes pérennes d'intérêt pour le Sud
Coordination :
Lauréate du deuxième prix Innovation Sud 2013, au sein de l'UMR DIADE, Frédérique Aberlenc-Bertossi a mis au point des marqueurs moléculaires permettant d'identifier précocement le sexe et le génotype du palmier dattier.
Frédérique
Aberlenc
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Romain
Guyot

L’équipe GENOPS conduit des recherches sur des plantes tropicales pérennes à forte valeur agronomique, principalement les palmiers et les caféiers, ainsi que leurs apparentés sauvages. Ces espèces sont au cœur des enjeux de sécurité alimentaire et économique, d’adaptation aux changements globaux et de durabilité des systèmes agricoles du Sud global. Les travaux visent à comprendre l’évolution des génomes et leurs liens avec des caractères adaptatifs et agronomiques clés, en mobilisant des approches de génomique comparative, de pangenomique, de transcriptomique et d’épigénomique. Les recherches portent notamment sur les systèmes reproducteurs (détermination du sexe et des chromosomes sexuels des palmiers), les voies de biosynthèse de métabolites d’intérêt (Caféine) et l’adaptation aux stress environnementaux. Elles bénéficie d’une forte expertise en histologie et en culture de tissus végétaux, permettant d’articuler recherche fondamentale et développement d’outils et de ressources génétiques pour les partenaires du Sud.

Mots clés
  • Génomique
  • Pangénomique
  • Épigénomique
  • Bioinformatique
  • Éléments transposables
  • Mécanisme de détermination du sexe
  • Systèmes de reproduction
  • Diversité génétique
  • Biotechnologie végétale
  • Palmiers
  • Caféiers.

Projets

Rufford fundation, Ex Situ Conservation of Three Coffea (Baracoffea) Species Adapted to the Semi-Arid Regions of Northwestern Madagascar:  https://www.rufford.org/projects/rickarlos-bezandry/ex-situ-conservation-three-coffea-baracoffea-species-adapted-semi-arid-regions-northwestern-madagascar/

Universidad Autonoma de Manizales, Colombia/ Cenicafé: Coffee leaf rust genome analysis

CAPES 22/03320-5 /CNPQ 441084/2023-0 Aroeira genome project

ARTS IRD PhD grant; Bactris gasipaes genome project

PalmElite: Freepalm Oil palm genome project

CNPQ 404419/2024-0 Comparative Genomics and Molecular Evolution of Proline Metabolism in Myrteae tribe species

RésiPalm : Résilience des agrosystèmes basés sur les palmiers au Bénin (Jeune Equipe Associée à l’IRD)

Publications

Sigle DIADE